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Grundlagen der Bioinformatik - VO |
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Institut:
Institut für Computational Biotechnologie
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Semesterstunden: 2
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Inhalt:
- Einführung in die Bioinformatik: Herausforderungen der Computational Biology, Proteinstrukturvorhersage, Homologiesuche, Genomanalyse, Gene-Finding, Alignments, phylogenetische Analyse
- Grundlagen der Informatik: Grundlegende Informatikkonzepte, Algorithmen, Rechenzeiten, Hardware, Software, Betriebssysteme, Datenbanken
- Grundlagen der Molekularbiologie: DNA, RNA, Gen, Genom, genetische Kodierung, Expression und Transmision genetischer Information, Proteine und Proteinstruktur
- Internetressourcen: TCP/IP, Internet, World Wide Web, Internet Ressourcen der Molekularbiologie
- Biologische Sequenzanalyse: Frequenzanalyse, Homologiebestimmung mittels paarweise Alignments, Datenbanksuche, Miltiple Alignments, Identifikation spezifischer Bereiche in Nukleinsäuresequenzen, Gene-Finding, Analyse von Proteinsequenzen, Genomanalyse
- Biologische Datenbanken: Die GenBank Sequence Datenbank, SWISS-PROT, Strukturdatenbanken, spezielle Datenbanken, Sequenzübereinstimmung und Datenbankanalyse
- Hidden Markov Modelle (HMM): HMM Grundlagen, Profil-HMMs, Datenbanksuche, Modelschätzung, HMMs für Gene-Finding, HMM-Anwendungen
- Machine Learning: Lernen aus Daten, Memory-based reasoning, Decision trees, Neuronale Netzwerke.
Quelle:
TUGraz-Online
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